种子的主要部分是胚，而胚是由胚根、胚轴、胚芽和子叶组成的，其中胚根与胚芽之间由胚轴相连．在种子萌发的过程中，胚根发育成植物的根，胚芽发育成植物的茎和叶，胚轴伸长发育成连接茎和叶的部分，子叶是种子植物胚的组成部分之一，为贮藏养料或幼苗时期进行同化作用的器官．

如图是大豆种子的结构示意图：

因此，在解剖和观察种子的结构时，胚根连接在胚轴上．

故选：A．