参考答案：A, C, D

解析：物流成本核算与应用中存在的问题包括：①物流成本核算的目的不明确；②物流成本的会计核算方法不明确；③物流成本核算与管理没有超出财务会计的范围；④物流成本核算的标准不统一；⑤缺乏懂得物流知识的财务会计与管理会计人员。