A、水是由分子构成的物质，所以水分子可以保持水的化学性质．正确．

B、电解水实验中，从电源负极上得到的气体是氢气，氢气能在空气中燃烧生成水．正确．

C、明矾可以净水是因为明矾溶于水时生成胶状物，该胶状物吸附悬浮于水中的杂质，使杂质从水中沉降下来．正确．

D、过滤可以把不溶于水的杂质除去，不能除去溶于水的杂质．错误．

故选：D．