参考答案：

1）氢键，多发生在多肽链中负电性很强的氮原子、氧原子与N-H或O-H的氢原子之间。

2）范德华力，由于其加和性对蛋白质构象影响较大。

3）疏水作用，主要是介质水分子对疏水基团的推斥所致。

4）盐键，主要存在于蛋白质分子中某些氨基酸之间。

5）二硫键，是很强的共价键，作用是将不同肽链或同一肽链的不同部分连接起来。

6）配位键，很多蛋白质中的金属离子与其他蛋白质间常以配位键连接。