裸子植物和被子植物都有根、茎、叶、种子等器官，裸子植物没有真正意义上的花，其产生种子的胚珠是裸露的，发育成的种子也是裸露的，外面没有果皮包被；被子植物具有真正的花，产生种子的胚珠外面有子房壁，当完成传粉和受精作用后，胚珠发育成种子，子房壁发育成果皮，包被着种子．因此种子植物分为裸子植物和被子植物的主要依据是种子外面有无果皮包被．

故选：D