参考答案：C

解析：[考点] 贪污罪、职务侵占罪中的共同犯罪 最高人民法院《关于审理贪污、职务侵占案件如何认定共同犯罪几个问题的解释》第3条规定：“公司、企业或者其他单位中，不具有国家工作人员身份的人与国家工作人员勾结，分别利用各自的职务便利，共同将本单位财物非法占为已有的，按照主犯的犯罪性质定罪。”甲是某国有公司控股的股份有限公司主管财务的副总经理，乙是该公司的财务主管，应认定为甲是主犯。因此，本题的答案是C。 [注意]注意贪污罪、职务侵占罪中的共同犯罪的认定，不具有国家工作人员身份的人与国家工作人员勾结，分别利用各自的职务便利，共同将本单位财物非法占为已有的，按照主犯的犯罪性质定罪。