小麦的高秆是由显性基因D控制，小麦的矮秆是由隐性基因d控制．小麦的高茎的基因组成是DD或Dd，小麦矮杆的基因组成是dd，染色体和基因在体细胞中成对存在，在生殖细胞中成单存在．卵细胞属于生殖细胞．因此小麦的卵细胞中控制矮茎的基因是d． 

故选：B．