小写字母表示隐性基因，因此单眼皮aa是隐性性状，双眼皮是显性性状．都是双眼皮的夫妇却生了一个单眼皮的孩子，说明夫妇双方控制眼皮的基因组成不是纯合的，即都含有一个控制双眼皮的显性基因A和一个控制单眼皮的隐性基因a即Aa；遗传图解如图所示：

故选D．