（1）由显性基因控制的性状是显性性状，由隐性基因控制的性状是隐性性状；在耳垂的有无这对相对性状的遗传中，小明出现了他的父母没有的性状，说明无耳垂是隐性性状，由隐性基因控制，那么有耳垂为显性性状，由显性基因控制．

（2）若用A表示显性基因，a表示隐性基因，则这对基因的遗传图解如图所示：则无耳垂的小明的基因组成是aa，其父母的基因组成是Aa．

（3）生物体的各种性状都是由基因控制的，性状的遗传实质上是亲代通过生殖细胞把基因传递给了子代，在有性生殖过程中，精子与卵细胞就是基因在亲子代间传递的桥梁；小明是由父亲产生的精子和母亲产生的卵细胞结合成的受精卵发育成的，因此，控制小明耳垂的基因一个来自父亲，另一个来自母亲．

故答案为：

（1）显性，隐性（2）aa，Aa（3）母方