参考答案：A, C, D

解析：类比法的应用包括：①进行生态影响识别和评价因子筛选；②以原始生态系统作为参照，可评价目标生态系统的质量；③进行生态影响的定性分析与评价；④进行某一个或几个生态因子的影响评价；⑤预测生态问题的发生与发展趋势及其危害；⑥确定环保目标和寻求最有效可行的生态保护措施。B项属于指数法的应用。