由l，m，n是不同的直线，α，β是不同的平面，知：

若m⊥α，m⊥β，则由平面平行的判定定理知α∥β，故A正确；

若l⊂α，α∥β，则由平面平行的性质定理知l∥β，故B正确；

若m∥n，m⊥α，则由直线垂直于平面的判定定理知n⊥α，故C正确；

若l⊂α，α⊥β，则l与β相交、平行或l⊂β，故D错误．

故选D．