答案：D

题目分析：显性基因用大写字母表示，显性性状的基因组成为：AA或Aa，隐性基因用地写字母表示，隐性性状的基因组成为：aa，由题目可知，人的双眼皮是显性性状，是由显性基因控制的，单眼皮是隐性性状，是由隐性基因控制的，爸爸是Aa，妈妈是aa，那么孩子的基因组成为Aa、aa，其中Aa性状为双眼皮，aa性状为单眼皮，小明是双眼皮，所以基因为Aa。

点评：此题为基础题，解答此题的关键是掌握并理解基因的显性和隐性以及它们与性状表现之间的关系，可结合遗传图解进行解题。