①有理数与数轴上的点一一对应是正确的；

②a=-2时，-a=2，是一个正数，故-a一定是一个负数是错误的；

③绝对值是非负数，故没有绝对值为-3的数是正确的；

④若|a|=a，则a是一个非负数，故若|a|=a，则a是一个正数的说法是错误的；

⑤数轴左边离原点越远的数越小是正确的．

正确的有3个．

故选C．