D 

题目分析：化学变化是指有新物质生成的变化，物理变化是指没有新物质生成的变化，化学变化与物理变化的本质区别是有无新物质生成，A、自然沉淀的过程中没有新物质生成，属于物理变化． B、砂层过滤的过程中只是将不溶物与水分离，没有新物质生成，属于物理变化． C、活性炭吸附是利用了活性炭的吸附性，没有新物质生成，属于物理变化． D、杀菌消毒的过程中消毒剂能破坏细菌中的物质，从而使细菌失去活性，杀菌消毒的过程中有新物质生成，属于化学变化．故选D．