答案：C

题目分析：考查定语和表语从句，第一空填why，引导定语从句，修饰the reason，定语从句中缺少原因状语，第二空是that，因为主语是the reason时，表语从句用that引导，句意是：他迟到的原因是他错过了火车。选C。

点评：先行词是the reason，而且定语从句不缺主宾表时，定语从句都是why引导，还有固定搭配，the reason why….is that….,要记牢。