A、元素是指具有相同核电荷数的一类原子的总称，所以元素是同类原子的总称，两者属于整体和个题的关系，所以元素是原子的一个归类“集体”，故A正确；

B、同种元素的原子核内质子数相同，中子数可能不同，所以同种元素的原子质量不一定相同，故B错；

C、元素是指具有相同核电荷数的一类原子的总称，所以决定元素种类的是核内质子数或核电荷数，故C错；

D、元素是指具有相同核电荷数的一类原子的总称，所以决定元素种类的是核内质子数或核电荷数，即不同种元素的根本区别是核内质子数不同，故D错．

故选A．