答案：C

题目分析：高茎豌豆AA与矮茎豌豆aa杂交后，子代的基因组成是Aa，控制矮茎的隐性基因a的性状不表现，但这个基因仍然会传递给下一代，如图所示：

后代进行自花受粉，则受精卵的基因组成类型有三种，故选C。