答案：C

题目分析：在细胞核中被碱性染料染成深色的物质是染色体。染色体由蛋白质和DNA组成，起遗传作用的是DNA分子，一条染色体上一般只有一条DNA分子，DNA分子上有许多的基因，DNA是主要的遗传物质，具有遗传效的DNA分子是基因。通过分析，选项C符合题意。