答案：D

与草履虫的基本结构相似的应该是动物细胞，该题中流感病毒为病毒，病毒不具有细胞结构，番茄果肉细胞和酵母菌分别是植物细胞和真菌．人的口腔上皮细胞和草履虫都是动物细胞，应具有相似的结构．

故选：D