A、垂直于同一直线的两条直线互相垂直，说法错误，应该是同一平面内垂直于同一直线的两条直线互相平行；

B、平行于同一条直线的两条直线互相平行，说法正确；

C、平面内两个角相等，则它们的两边分别平行，说法错误，例如两直线互相垂直时，两个相邻的直角就相等；

D、两条直线被第三条直线所截，同位角相等，说法错误，应是两条平行的直线被第三条直线所截，同位角相等；

故选：B．