A、器官是由不同的组织按照一定的次序结合在一起构成的，A错误；

B、保护组织一般由植物根、茎、叶表面的表皮细胞构成，位于植物体的最外面，具有保护内部柔嫩部分的功能，B正确；

C、上皮组织是动物组织，C错误；

D、植物的组织主要有：分生（基本）组织、保护组织、营养组织、输导组织、机械组织等，D错误．

故选：B