参考答案：D

解析：[考点] 指定管辖 《高法刑诉解释》第22条规定，上级人民法院在必要的时候，可以将下级人民法院管辖的案件指定其他下级人民法院管辖。第17条规定，两个以上同级人民法院都有权管辖的案件，由最初受理的人民法院管辖。尚未开庭审判的，在必要的时候，可以移送被告人主要犯罪地的人民法院审判。对管辖权发生争议的，应当在审限内协商解决；协商不成的，由争议的人民法院分别逐级报请共同的上一级人民法院指定管辖。根据该条，甲省与乙省中级人民法院的共同上级是最高人民法院，因此应当由最高人民法院指定。所以D项正确，应当选。