答案：D

①只有两直线平行，同位角才相等，故本小题错误；

②凡直角都相等，正确；

③根据定义，一个角的余角比补角小90°，所以一个角的余角一定比它的补角小，正确；

④在直线、射线和线段中，只有线段有长短，直线是向两方无限延伸的，没有长度，故本小题错误；

⑤两点之间的线段的长度就是这两点间的距离，正确；

⑥如果一个角的两边分别平行于另一个角的两边，则这两个角相等或互补，故本小题错误；

所以，正确的有②③⑤共3个．

故选D．