答案：A

题目分析：由题意规定运入为正，则运出为负，即可得到结果.

如果＋3吨表示运入仓库的大米吨数，那么运出3.5吨大米表示为－3.5吨，

故选A.

点评：解答本题的关键是明确一对相反意义的量，其中一个为正，另一个就为负.