答案：A

题目分析：根据正数和负数的相对性可知运入为正，则运出应表示为负，即可求得结果.

如果＋3吨表示运入仓库3吨大米，则运出5吨大米表示为-5吨，故选A.

点评：本题属于基础应用题，只需学生熟练掌握正数和负数的相对性，即可完成.