答案：B

题目分析：因为泉州人口出生率为1.09%，死亡率为0.55%，人口自然增长率=出生率-死亡率=1.09%-0.55%=0.54%。

点评：本题主要考查了人口自然增长率的求法，解题的关键是牢记公式：人口自然增长率=出生率-死亡率。