参考答案：A, C, D

解析：

物流成本核算与应用中存在的问题包括：

①物流成本核算的目的不明确；

②物流成本的会计核算方法不明确；

③物流成本核算与管理没有超出财务会计的范围；

④物流成本核算的标准不统一；

⑤缺乏懂得物流知识的财务会计与管理会计人员。