克隆羊多莉的诞生过程如图所示：克隆羊多莉的长相供核母羊B一样，说明遗传物质存在于细胞核中．因此克隆羊多利的遗传物质主要来自供核母羊的细胞核．也就是说遗传物质存在于细胞核中．

故选：C