答案：C

题目分析：A.竹子的地下茎上长出许多竹笋，是用茎进行的繁殖，不经过两性生殖细胞的结合，属于无性繁殖，故不符合题意；

B.插入土壤中的柳树枝长成一株新个体，是用茎进行的繁殖，不经过两性生殖细胞的结合，属于无性繁殖，故不符合题意；

C.将水稻父本的花粉传给母本培育出杂交种子，在形成种子的时候有两性生殖细胞（精子和卵细胞）的结合形成的受精卵的过程，属于有性生殖，故符合题意；

D.水蜜桃与毛桃嫁接后结出新桃，是嫁接繁殖，无两性生殖细胞的结合，属于无性繁殖，故不符合题意；

故选C