①相等的角不一定是对顶角，可以是矩形的两个内角，故说法错误；   

②根据垂线的唯一性可知，过一点有且只有一条直线与已知直线垂直，故说法正确；   

③根据同位角的定义：两条直线被第三条直线所截形成的角中，若两个角都在被截两直线的同侧，并且在第三条直线（截线）的同旁，则这样一对角叫做同位角，故说法错误；      

④若点P不在线段AB上，即使线段AP=BP，那么P也不是AB中点，故说法错误；

⑤A与B两点间的距离是指连接A、B两点间的线段的长度，故说法错误．

故选D．