①邻补角互补，正确；

②对顶角相等，正确；

③被截线不平行则同旁内角不互补，故本小题错误；

④两点之间线段最短，是线段的性质，正确；

⑤直线是向两方无限延伸的，没有长短，故本小题错误；

⑥0没有倒数，故本小题错误；

⑦如果a²=b²，那么a=b或a=-b，故本小题错误；

⑧三角对应相等的两三角形相似但不一定全等，故本小题错误；

⑨如果∠A+∠B=90°，那么∠A与∠B互余，是定义，正确．

综上所述，真命题有①②④⑨共4个．

故选B．