威胁生物多样性的原因有栖息地被破坏、人类的滥捕乱杀和外来物种的入侵、环境污染等原因．当前由于人类活动的加剧，使生物多样性面临威胁，如滥砍乱伐造成栖息地的破坏、过度采伐、环境污染、生物入侵等．大量排放废水废气造成环境污染，会使生物的栖息地被破坏，是生物多样性面临威胁的主要原因．因此，D符合题意．

故选D